本校自114年度獲教育部核定為「跨域彈性修業試辦計畫」唯一入選之私立綜合大學以來，持續強化學生跨域探索與整合應用能力。在教學創新方面，本校攜手NVIDIA打造「智慧創新AI學習中心」，提升學生AI科技應用與實作能力；並與台灣半導體研究中心合作，開設「增能半導體學分學程暨微學程」，引導學生提早接軌半導體產業脈動，積極因應AI、半導體及永續發展等關鍵產業之多元人才需求。在善盡社會責任、深化產學合作及提升高教公共性方面，本校亦展現多元成果，包括於教育部114學年度大專校院職涯輔導成果評選中榮獲績優職輔學校銅等獎、傑出職輔人員金等獎及資深職輔人員銅等獎；東吳實踐家創創基地團隊積極參與「U-start創新創業計畫」，並於115年獲百萬級補助；同時，本校亦持續於大學永續報告書及永續行動相關評比中獲獎肯定，展現長期投入永續治理之成效。綜上所述，本校致力推動跨域整合與多元人才培育，持續強化教育創新與社會連結。
第二期高等教育深耕計畫自112年度起推動，為期五年。本校透過前期三年資源投入（Input），持續檢視關鍵績效指標（Output）及學生關鍵能力與共通職能之成長情形（Outcome、Impact），以系統性評估計畫成效與影響力。同時，以校務研究（IR）為基礎，透過數據分析驗證資源投入效益，作為計畫持續精進的重要依據。在成效與影響力分析方面，本校以「學生學習成效長期追蹤問卷」為核心，向上對應高教深耕計畫六大關鍵能力，向下銜接UCAN八大共通職能架構，追蹤學生四年學習歷程，並輔以大一及大三UCAN共通職能檢測結果進行分析。110至113學年度連續四年分析結果顯示，學生各項關鍵能力與職場競爭力均呈穩定成長趨勢，顯示高教深耕計畫已具實質成效，相關成果亦持續回饋至新一期計畫規劃與執行，落實以數據驅動決策、以證據支持治理之發展理念。